L'
EQUIPE M3V: MODELISATION MULTI-ECHELLES DE LA MATIERE VIVANTE
vous invite au
voir les pages des EDITIONS 2009
et 2010
organisation : Jean-Marc Victor info pratiques : - il n'y a pas de frais de participation au
colloque PROGRAMME
Nous organisons à Jussieu pour la troisième année consécutive un colloque sur
l'architecture
fonctionnelle des chromosomes. L'objectif de cette réunion est
de confronter les approches (théorie, simulation, expérience) et les
disciplines (physique, biologie, chimie, informatique, mathématique)
autour de la question complexe du maintien de l'intégrité du matériel
génétique et du contrôle de son expression par l'architecture et la
dynamique des chromosomes (qu'ils soient eucaryotes ou procaryotes).
En combinant les techniques expérimentales de la biologie moléculaire
et cellulaire, les approches haut-débits (génomique, transcriptomique),
les moyens d'analyse de données de la (bio)informatique et des
mathématiques, les outils de simulation de la physique théorique et les
techniques récentes d'animation 3D, il devient possible d'élaborer une
approche intégrée de l'architecture des chromosomes - et
de l'information qu'ils portent - aux différentes échelles de taille
impliquées.
D'importants progrès ont récemment été réalisés
concernant la mesure de la distribution et de l'état des nucléosomes le
long du génome, ainsi que les repliements tridimensionnels de ce
dernier, progrès qui permettent d'envisager à court terme l'obtention
d'une ébauche de structure pour les chromosomes et leur organisation
dans le noyau.
Les thèmes suivants (liste non exhaustive) entrent
dans le cadre de cette réunion:
(i) positionnement des nucléosomes: comment ils sont
induits par la séquence, comment ce positionnement influence
l'architecture en interphase et en métaphase;
(ii) dynamique du chromosome au cours du cycle cellulaire;
(iii) rôle de l'architecture nucléaire dans:
* la régulation de l'expression génétique lors des différentes étapes
de la transcription;
* la mise en place de la différentiation cellulaire;
* le métabolisme de l'ADN (réplication, recombinaison, réparation).
Christophe Lavelle
Julien Mozziconacci
Maria Barbi
- pour une demande de participation s'adresser à Jean-Marc Victor, victor@lptmc.jussieu.fr
Lieu : UPMC, campus Jussieu, Amphi Astier (situé dans le Bâtiment
Esclangon, au pied de la Tour 66)
13h:
Buffet d'accueil
14h00:
Introduction
14h15:
Philippe Andrey et Valérie Gaudin, Institut Jean-Pierre Bourgin (INRA, Versailles)
"Modélisation de l'architecture nucléaire chez Arabidopsis thaliana"
14h45:
Elphège Nora Unité Génétique Biologie du Développement (équipe Edith
Heard, Institut
Curie, Paris)
"Nuclear and Chromosome Dynamics during development and X-Chromosome Inactivation"
15h15-16h:
Table ronde "Quels organismes modèles pour quels objectifs de modélisation? Intérêt de confronter procaryotes et eucaryotes; et eucaryotes entre eux."
16h-16h30:
Coffee break
16h30:
Brigitte Hartmann, Equipe DSIMB (INSERM-Paris 7)
"Propriétés structurales et dynamiques de l'ADN: implications pour la formation du nucléosome"
17h:
Amélie Leforestier, Laboratoire de physique des solides d'Orsay (CNRS-Paris 11, Orsay)
"Architecture du chromosome des bactériophages : polymorphisme et transitions de phase"
17h30-18h:
table ronde "Quelle physique pour les approches haut-débit?
Comment vivre à l'interface? Débat sur la nouvelle section du Comité National du CNRS autour de l'interface Biologie/Informatique/Mathématique/Physique et Chimie théoriques."
9h00:
Café d'accueil
9h30:
Clémence Kress et Kiên Kiêu, INRA
Jouy-En-Josas
"Nuclear organization of mammary epithelial cells
/
Statistical tools for analyzing nuclear features with preferred radial locations"
10h15:
Martine Yerle, INRA
Toulouse
"Nuclear architecture and gene expression"
10h45-11h15:
Table ronde : "Comment intéragir avec d'autres réseaux thématiques (GDRE SysBio,
GDR Réplication, colloques 3R, ...) ?"
11h15-11h45:
Coffee break
11h45:
Marie-Claude Marsolier-Kergoat,Institut
de biologie et de technologies de Saclay (CEA)
"A model for the influence of meiotic conversion tracts on gene GC content"
12h15:
Ralf Blossey, IRI
- Institut de Recherche Interdisciplinaire (CNRS, Lille)
"Kinetic proofreading of chromatin remodeling: the case of ISWI/ACF"
12h45-13h00:
Conclusions
13h00:
Fin de la réunion