Nous
organisons
à Jussieu pour la deuxième année
un colloque informel sur l' "architecture
fonctionnelle
du
chromosome eucaryote". Des progrès importants viennent en
effet d'être réalisés en matière de
positionnement des nucléosomes qui permettent d'envisager
à court terme l'obtention d'une ébauche de
structure pour
les chromosomes de levure. Par ailleurs les techniques récentes
de la réalité virtuelle offrent les moyens d'aborder
également les aspects fonctionnels de ces structures. L'objectif
de cette réunion est de faire émerger des collaborations
sur les sujets suivants (liste non exhaustive):
1. architecture
et positionnement des nucléosomes:
* comment la
séquence induit le positionnement des nucléosomes
* comment le
positionnement organise l'architecture :
en
interphase (structure des fibres), en métaphase (absence de
fibres?)
2. architecture
et cycle cellulaire:
* dynamique du chromosome
au
cours du cycle cellulaire
* rôle de
l'architecture dans les différentes étapes de la
transcription :
à
l'échelle de la fibre (rôle du supercoiling) ;
à l'échelle du noyau
*
rôle
des ARN dans la régulation transcriptionnelle
* architecture et
réplication
3. Table
ronde:
Quel organisme modèle pour quel objectif ?
Intérêt et limites de
la levure.
PROGRAMME
Jeudi
10
juin
|
13h30
Accueil
|
13h50
Introduction
|
14h
-
15h35. Session 1: Positionnement des nucléosomes etc...
(aspects physiques et biologiques)
|
Pascale
Milani
|
Lab.
Joliot-Curie,
ENS, Lyon |
Approche expérimentale et
théorique du positionnement nucléosomal
|
Guillaume
Chevereau |
Lab.
Joliot-Curie,
ENS, Lyon |
Olivier
Cuvier
|
LBME,
Toulouse |
Genome-wide Insulator-encoded
Nucleosome-Positioning:
Regulation of Transcriptional Pausing to Control the Cell Cycle
+ figure |
Kerstin
Bystricky
|
LBME,
Toulouse |
Live cell microscopy approaches to
dissect chromatin dynamics in 3D at high temporal resolution
|
15h40 - 17h15. Session 2:
Réplication (aspects physiques et biologiques)
|
Claude
Thermes |
CGM,
Gif-sur-Yvette |
Spatio-temporal
organisation of replication
Part I : Evidence of large scale gradients in the orientation of fork
progression
|
Benjamin
Audit
|
Lab.
Joliot-Curie,
ENS, Lyon |
Spatio-temporal organisation of
replication
Part II : Relation to
open chromatin encoded in DNA sequence
|
Arach
Goldar
|
CEA,
Gif-sur-Yvette |
Measuring the time dependent rate of
replication origin activation in a single Saccharomyces cerevisiae cell
by using population dynamics |
Marcel
Méchali
|
IGH,
Montpellier |
DNA replication: from origin recognition
to cell identity
|
1715 - 17h45. Pause.
|
17h45 - 19h20. Session 3: organisation
spatiale, procaryotes, diffusion
|
Angela
Taddei |
Inst.
Curie,
Paris |
Clustering
heterocromatin: Sir3 promotes telomere clustering independently of
silencing in budding yeast |
Olivier
Espéli
|
CGM,
Gif-sur-Yvette |
Analysis of the spatial organization of
the bacterial chromosome
|
Ivan
Junier
|
ISC,
Paris |
Spatial and topological organization of
DNA chains induced by gene co-localization |
Olivier
Bénichou
|
LPTMC,
Paris
|
First-passage times of diffusion
processes and Geometry-controlled kinetics
|
20h30
DINER
|
Vendredi
11
juin
|
9h
Accueil
|
9h30
-
10h45. Session 4: biologie des systèmes, réparation,
"foci" (aspects physiques et (radio)biologiques)
|
Arndt
Benecke
|
IRI,
Lille |
|
Christophe
Escudé
|
MNHN,
Paris |
Repeated DNA sequences and nuclear
architecture : new approaches
|
Nicolas
Foray
|
Faculté
de
Médecine Lyon-Sud
|
Individual susceptibility to
radiosensitivity and to genomic instability: its impact on chromatin
remodelling and nuclear foci pattern
|
Olivier
Piétrement
|
IGR,
Paris |
|
10h45
-
11h15. Pause
|
11h15
-
12h30. session 5: Approches multi-échelles de l'architecture
nucléaire
|
Annick
Lesne
|
LPTMC,
UPMC,
Paris |
Functional
architecture and dynamics of the chromatin fiber: a systemic viewpoint |
Ralf
Everaers
|
ENS,
Lyon |
A
local and a global view on chromosmal structure: the nucleosomal stem
versus chromosome territories
|
Thierry
Forné
|
IGM,
Montpellier |
Dynamics and supranucleosomal organization
of the mammalian chromatin: a contribution of the 3C-qPCR method
|
Alexander
Grosberg
|
New
York
university |
Crumpled globule model of chromosomes
|
|
 |
organisation
: |
Jean-Marc Victor
Christophe Lavelle
Julien Mozziconacci
Maria Barbi
|
|
|
liste des
participants :
|
Katia
Ancelin
|
Inst. Curie, Paris |
Alain
Arnéodo
|
Lab.
Joliot-Curie, ENS, Lyon |
Benjamin Audit
|
Lab.
Joliot-Curie, ENS, Lyon |
Antoine Baker
|
Lab.
Joliot-Curie, ENS, Lyon |
Aurélien
Bancaud
|
LAAS, Toulouse |
Maria Barbi
|
LPTMC, UPMC, Paris |
Arndt Benecke
|
IRI, Lille |
Olivier
Bénichou
|
LPTMC, UPMC, Paris |
David Bensimon
|
ENS, Paris |
Ralf Blossey
|
IRI, Lille |
Frédéric
Boccard
|
CGM,
Gif-sur-Yvette |
Jean-Baptiste
Boulé
|
Inst. Curie, Paris |
Kerstin Bystricky
|
LBME, Toulouse |
Pascal Carrivain
|
LPTMC, UPMC, Paris |
Guillaume
Chevereau
|
Lab.
Joliot-Curie, ENS, Lyon |
Natalia Conde e
Silva
|
IBP, Orsay
|
Olivier Cuvier
|
LBME, Toulouse |
Anne de Cian
|
IGR, Paris |
Jeril Degrouard
|
LPS, Orsay |
Marion Dubarry
|
Inst. Curie, Paris |
Karine Dubrana
|
Inst. Curie, Paris |
Sebastian
Eilebrecht
|
IRI, Lille |
Christophe
Escudé
|
MNHN, Paris |
Olivier
Espéli
|
CGM,
Gif-sur-Yvette |
Ralf Everaers
|
ENS, Lyon |
Emmanuelle Fabre
|
Inst. Pasteur,
Paris |
Nicolas Foray |
Faculté de
Médecine Lyon-Sud |
Thierry
Forné
|
IGM, Montpellier |
Franck Gallardo
|
LBME, Toulouse |
Arach Goldar
|
CEA,
Gif-sur-Yvette |
Alexander Grosberg
|
New York
university |
Marc
Guéroult
|
INTS, Paris |
Brigitte Hartmann
|
INTS, Paris |
Edith Heard
|
Inst. Curie, Paris |
Magali Hennion
|
LBME, Toulouse |
Sebastien Herbert
|
Ecole Doctorale
FDV, Paris
|
Sebastien Huet
|
EMBL, Heidelberg
|
Olivier Hyrien
|
ENS, Paris |
Ivan Junier
|
ISC, Paris |
François
Képès
|
Genopole, Evry |
Romain Koszul
|
Inst. Pasteur,
Paris |
Jean Krivine
|
IRI, Lille |
Yves Lansac
|
LPS, Orsay |
Imen Lassadi
|
LBME, Toulouse |
Christophe Lavelle
|
IRI-IHES, Lille
|
Marc Lavigne
|
Inst. Pasteur,
Paris |
Eric le Cam
|
IGR, Paris |
Nicolas Lemercier
|
LPS, Orsay |
Annick Lesne
|
LPTMC, UPMC, Paris |
Kathrin Marheineke
|
ENS, Paris |
Olivier Mauffret
|
LBPA, ENS-Cachan
|
Marcel
Méchali
|
IGH, Montpellier |
Sam Meyer
|
ENS, Lyon |
Pascale Milani
|
Lab.
Joliot-Curie, ENS, Lyon |
Julien
Mozziconacci
|
LPTMC, UPMC, Paris |
Christophe Oguey
|
LPTM, Cergy |
Fabien Paillusson
|
LPTMC, UPMC, Paris |
Olivier
Piétrement
|
IGR, Paris |
Sophie Queille
|
LBME, Toulouse |
Aurélien
Rappailles
|
ENS, Paris |
Sylvie Rimsky
|
LBPA, ENS, Cachan |
Myriam Ruault
|
Inst. Curie, Paris |
Angela Taddei
|
Inst. Curie, Paris |
Nicolas Tchichek
|
IRI, Lille |
Claude Thermes
|
CGM,
Gif-sur-Yvette |
Cedric Vaillant
|
Lab.
Joliot-Curie, ENS, Lyon |
Jean-Marc Victor
|
LPTMC, UPMC, Paris |
Raphaël
Voituriez
|
LPTMC, UPMC, Paris |
Hua Wong
|
Inst. Pasteur,
Paris |
Xiaoqin Xu
|
LBPA, ENS-Cachan
|
Christophe Zimmer
|
Inst. Pasteur,
Paris |
|
|
|