L'EQUIPE M3V: MODELISATION MULTI-ECHELLES DE LA MATIERE VIVANTE
vous invite au

COLLOQUE
Architecture nucléaire et dynamique fonctionnelle des chromosomes
UPMC, Paris, 10-11 juin 2010
Amphi Astier

voir la page de l' EDITION 2009

Nous organisons à  Jussieu pour la deuxième année un colloque informel sur l' "architecture fonctionnelle du chromosome eucaryote". Des progrès importants viennent en effet d'être réalisés en matière de positionnement des nucléosomes qui permettent d'envisager à  court terme l'obtention d'une ébauche de structure pour les chromosomes de levure. Par ailleurs les techniques récentes de la réalité virtuelle offrent les moyens d'aborder également les aspects fonctionnels de ces structures. L'objectif de cette réunion est de faire émerger des collaborations sur les sujets suivants (liste non exhaustive):

 1. architecture et positionnement des nucléosomes:
          * comment la séquence induit le positionnement des nucléosomes
          * comment le positionnement organise l'architecture :
              en interphase (structure des fibres), en métaphase (absence de fibres?)

 2. architecture et cycle cellulaire:
       dynamique du chromosome au cours du cycle cellulaire
       *  rôle de l'architecture dans les différentes étapes de la transcription :
            à  l'échelle de la fibre (rôle du supercoiling) ; à  l'échelle du noyau
        * rôle des ARN dans la régulation transcriptionnelle
        * architecture et réplication

 3.  Table ronde: Quel organisme modèle pour quel objectif ? Intérêt et limites de
       la levure.



PROGRAMME

Jeudi 10 juin
13h30 Accueil
13h50 Introduction
14h - 15h35. Session 1: Positionnement des nucléosomes etc... (aspects physiques et biologiques)
Pascale Milani Lab. Joliot-Curie, ENS, Lyon Approche expérimentale et théorique du positionnement nucléosomal
Guillaume Chevereau Lab. Joliot-Curie, ENS, Lyon
Olivier Cuvier LBME, Toulouse Genome-wide Insulator-encoded Nucleosome-Positioning:
Regulation of Transcriptional Pausing to Control the Cell Cycle
       +        figure
Kerstin Bystricky LBME, Toulouse Live cell microscopy approaches to dissect chromatin dynamics in 3D at high temporal resolution
15h40 - 17h15. Session 2: Réplication (aspects physiques et biologiques)
Claude Thermes CGM, Gif-sur-Yvette Spatio-temporal organisation of replication
Part I : Evidence of large scale gradients in the orientation of fork progression
Benjamin Audit
Lab. Joliot-Curie, ENS, Lyon Spatio-temporal organisation of replication
Part II : Relation to open chromatin encoded in DNA sequence

Arach Goldar CEA, Gif-sur-Yvette Measuring the time dependent rate of replication origin activation in a single Saccharomyces cerevisiae cell by using population dynamics
Marcel Méchali IGH, Montpellier DNA replication: from origin recognition to cell identity
1715 - 17h45. Pause.
17h45 - 19h20. Session 3: organisation spatiale, procaryotes, diffusion
Angela Taddei Inst. Curie, Paris Clustering heterocromatin: Sir3 promotes telomere clustering independently of silencing in budding yeast
Olivier Espéli CGM, Gif-sur-Yvette Analysis of the spatial organization of the bacterial chromosome
Ivan Junier 
ISC, Paris Spatial and topological organization of DNA chains induced by gene co-localization
Olivier Bénichou
LPTMC, Paris
First-passage times of diffusion processes and Geometry-controlled kinetics
20h30 DINER
Vendredi 11 juin
9h Accueil
9h30 - 10h45. Session 4: biologie des systèmes, réparation, "foci" (aspects physiques et (radio)biologiques)
Arndt Benecke IRI, Lille
Christophe Escudé
MNHN, Paris Repeated DNA sequences and nuclear architecture : new approaches
Nicolas Foray
Faculté de Médecine Lyon-Sud
Individual susceptibility to radiosensitivity and to genomic instability: its impact on chromatin remodelling and nuclear foci pattern
Olivier Piétrement
IGR, Paris
10h45 - 11h15. Pause
11h15 - 12h30. session 5: Approches multi-échelles de l'architecture nucléaire
Annick Lesne LPTMC, UPMC, Paris Functional architecture and dynamics of the chromatin fiber: a systemic viewpoint
Ralf Everaers
ENS, Lyon A local and a global view on chromosmal structure: the nucleosomal stem versus chromosome territories
Thierry Forné
IGM, Montpellier Dynamics and supranucleosomal organization of the mammalian chromatin: a contribution of the 3C-qPCR method
Alexander Grosberg
New York university Crumpled globule model of chromosomes

organisation :  Jean-Marc Victor
Christophe Lavelle
Julien Mozziconacci
Maria Barbi


info pratiques :  - il n'y a pas de frais de participation au colloque
- pour une demande de participation s'adresser à
  Jean-Marc Victor, victor@lptmc.jussieu.fr

Lieu : UPMC, campus Jussieu, Amphi Astier
(situé dans le Bâtiment Esclangon, au pied de la Tour 66)

venir à  l'UPMC, campus Jussieu,
et trouver le Bâtiment Esclangon

 




liste des
participants :

Katia Ancelin 
Inst. Curie, Paris
Alain Arnéodo
Lab. Joliot-Curie, ENS, Lyon
Benjamin Audit
Lab. Joliot-Curie, ENS, Lyon
Antoine Baker
Lab. Joliot-Curie, ENS, Lyon
Aurélien Bancaud
LAAS, Toulouse
Maria Barbi
LPTMC, UPMC, Paris
Arndt Benecke
IRI, Lille
Olivier Bénichou
LPTMC, UPMC, Paris
David Bensimon
ENS, Paris
Ralf Blossey
IRI, Lille
Frédéric Boccard
CGM, Gif-sur-Yvette
Jean-Baptiste Boulé
Inst. Curie, Paris
Kerstin Bystricky
LBME, Toulouse
Pascal Carrivain
LPTMC, UPMC, Paris
Guillaume Chevereau
Lab. Joliot-Curie, ENS, Lyon
Natalia Conde e Silva
IBP, Orsay
Olivier Cuvier
LBME, Toulouse
Anne de Cian
IGR, Paris
Jeril Degrouard
LPS, Orsay
Marion Dubarry
Inst. Curie, Paris
Karine Dubrana
Inst. Curie, Paris
Sebastian Eilebrecht
IRI, Lille
Christophe Escudé
MNHN, Paris
Olivier Espéli
CGM, Gif-sur-Yvette
Ralf Everaers
ENS, Lyon
Emmanuelle Fabre
Inst. Pasteur, Paris
Nicolas Foray Faculté de Médecine Lyon-Sud
Thierry Forné
IGM, Montpellier
Franck Gallardo
LBME, Toulouse
Arach Goldar
CEA, Gif-sur-Yvette
Alexander Grosberg
New York university
Marc Guéroult
INTS, Paris
Brigitte Hartmann
INTS, Paris
Edith Heard
Inst. Curie, Paris
Magali Hennion
LBME, Toulouse
Sebastien Herbert
Ecole Doctorale FDV, Paris
Sebastien Huet
EMBL, Heidelberg
Olivier Hyrien
ENS, Paris
Ivan Junier
ISC, Paris
François Képès
Genopole, Evry
Romain Koszul
Inst. Pasteur, Paris
Jean Krivine
IRI, Lille
Yves Lansac
LPS, Orsay
Imen Lassadi
LBME, Toulouse
Christophe Lavelle
IRI-IHES, Lille
Marc Lavigne
Inst. Pasteur, Paris
Eric le Cam
IGR, Paris
Nicolas Lemercier
LPS, Orsay
Annick Lesne
LPTMC, UPMC, Paris
Kathrin Marheineke
ENS, Paris
Olivier Mauffret
LBPA, ENS-Cachan
Marcel Méchali
IGH, Montpellier
Sam Meyer
ENS, Lyon
Pascale Milani
Lab. Joliot-Curie, ENS, Lyon
Julien Mozziconacci
LPTMC, UPMC, Paris
Christophe Oguey
LPTM, Cergy
Fabien Paillusson
LPTMC, UPMC, Paris
Olivier Piétrement
IGR, Paris
Sophie Queille
LBME, Toulouse
Aurélien Rappailles
ENS, Paris
Sylvie Rimsky
LBPA, ENS, Cachan
Myriam Ruault
Inst. Curie, Paris
Angela Taddei
Inst. Curie, Paris
Nicolas Tchichek
IRI, Lille
Claude Thermes
CGM, Gif-sur-Yvette
Cedric Vaillant
Lab. Joliot-Curie, ENS, Lyon
Jean-Marc Victor
LPTMC, UPMC, Paris
Raphaël Voituriez
LPTMC, UPMC, Paris
Hua Wong
Inst. Pasteur, Paris
Xiaoqin Xu
LBPA, ENS-Cachan
Christophe Zimmer
Inst. Pasteur, Paris